Δυόμισι χρόνια μετά την καταδίκη του σε πρώτο βαθμό, ο παιδεραστής-προπονητής Νίκος Σειραγάκης, επρόκειτο να δικαστεί σε δεύτερο βαθμό, το πρωί της Παρασκευής στο Μικτό Ορκωτό Εφετείο Πειραιά. Ωστόσο η πλευρά της υπεράσπισης κατέθεσε αίτημα αναβολής, το οποίο έγινε δεκτό από το Δικαστήριο.

Συνολικά, είχαν κληθεί από το δικαστήριο να καταθέσουν 18 άτομα, εκ των οποίων τα 11 είναι αστυνομικοί της υποδιεύθυνσης Ασφαλείας Ρεθύμνου, τα οποία είχαν επιφορτιστεί με την παρακολούθηση του δράστη και τη σύλληψη του τον Δεκέμβριο του 2011.

Στις 16 Μαΐου 2013 και ύστερα από πολυήμερη ακροαματική διαδικασία, το Μικτό Ορκωτό Δικαστήριο Πειραιά, έκρινε τον παιδεραστή ένοχο για 36 κακουργηματικές πράξεις και τον καταδίκασε σε ποινή κάθειρξης 401 ετών.

Το δικαστήριο είχε απορρίψει το αίτημά του για αναγνώριση ελαφρυντικών. Είχε απορρίψει επίσης το αίτημά του για να έχει αναστέλλουσα δύναμη η έφεσή του και παρέμεινε έγκλειστος στις φυλακές Τρίπολης όπου εκρατείτο από την ημέρα που απολογήθηκε στον ανακριτή Ρεθύμνου και είχε κριθεί προφυλακιστέος με ομόφωνη γνώμη του εισαγγελέα.